Gabedit

Gabedit es una interfaz gráfica de usuario de Gauss, Molcas, Molpro y MPQC paquetes de química computacional.
 
 Gabedit incluye facilidades gráficas para generar palabras clave y opciones, especificaciones de moléculas y ther secciones de entrada, incluso para los tipos de cálculo más avanzados Gabedit incluye un constructor molécula avanzada.
 
 Usted puede utilizarlo para dibujar rápidamente en moléculas y examinarlas en tres dimensiones. Usted puede construir moléculas por átomo, anillo, grupo, de aminoácidos y nucleósidos. También puede leer la geometría de un archivo. La mayoría de los principales formatos de archivos molecular son compatibles.
 
 Gabedit incluye una ventana de configuración de cálculo de Gauss, Molcas, Molpro y MPQC que le permite configurar de Gauss, Molcas, Molpro y MPQC trabajos de una manera sencilla y directa.
 
 Gabedit incluye un editor de texto para editar Molcas, Molpro, archivos de entrada Gaussianos y MPQC.
 
 Gabedit gráfica puede mostrar una variedad de Gauss, Molcas, Molpro, MPQC y (parcialmente) los resultados del cálculo del ADF, incluyendo las siguientes:
 
 ย ท orbitales moleculares.
 ย ท superficies a partir de la densidad electrónica, potencial electrostático, densidad de RMN de blindaje, y otras propiedades.
 ย ท superficies se pueden mostrar en los modos de malla sólidos, translúcidos y alambre.
 ย ท superficies pueden ser de color por una separación de bienes.
 ย ท Contornos (código de color).
 ย ท Planes (código de color).
 ย ท dipolo
 ย ท ejes XYZ y los ejes principales de la molécula.
 ย ท Animación de los modos normales correspondientes a las frecuencias vibratorias.
 ย ท Animación de la rotación de la geometría, superficie, dipolo, xyz y los ejes principales de la molécula.
 ย ท Animación de los contornos.
 ย ท Animación de planos código de color.
 
 Gabedit puede mostrar IR y Raman computado espectros. Gabedit puede generar un archivo de povray de geometría (átomos + bonos, incluidos los bonos de hidrógeno), superficies (incluyendo superficies de código de color), contornos, aviones código de color.
 
 Gabedit puede guardar la imagen en PPM, BMP, (JPEG) y el formato PS. Gabedit puede generar automáticamente una serie de imágenes para la animación (vibración, la convergencia geometría, rotación, contornos, aviones código de color)

¿Qué hay de nuevo en esta versión:

• Errores menores han sido corregidos.
• NWChem es ahora compatible.
• Los juegos nativos de Windows es ahora compatible.

¿Qué hay de nuevo en la versión 2.3.5:.

• Errores menores fueron fijadas
• Los átomos pueden ser fijos durante una simulación de dinámica molecular.
• Migración de El Cairo a OpenGL para dibujar la ventana de geometría.
• La migración de GtkGLArea a gtkglext.
• Paralelización usando OpenMP.

¿Qué hay de nuevo en la versión 2.3.0:.

• Errores menores fueron fijadas
• El usuario puede leer los orbitales, la geometría y los modos normales de un archivo de Gauss fchk.
• Se puede leer los orbitales del nuevo formato de archivo aux mopac (incluyendo el formato comprimido).
• Varias nuevas opciones en XYPlot y ContoursPlot ventanas (texto inserto, línea, flecha, imágenes, nuevos temas ...).
• Las longitudes de enlace pueden ser fijos durante una simulación MD.
• optimización parcial es ahora posible con el potencial MM.
• La implementación de una herramienta para predecir las masas y abundancias de los isótopos para una molécula dada. La implementación de una herramienta para calcular las susceptibilidades electrófilos, nucleófilos y radicales para una molécula.

¿Qué hay de nuevo en la versión 2.2.0:

• Errores menores fueron fijadas
• Todos los cambios geométricos se puede deshacer y rehacer utilizando el Deshacer y Rehacer (u / U o Ctrl z / Ctrl y)
• El usuario tiene un control completo sobre los enlaces que aparecen en un dibujo.
• El dibujo del átomo a átomo molécula se han simplificado.
• El dibujo de la molécula de fragmento a fragmento se han simplificado.
• Gabedit leer conectividades de Gabedit, hin, pdb, mol2 y moles.
• El usuario puede establecer el valor de la distancia, ángulo de enlace y el ángulo diedro.
• Un dinámica molecular de búsqueda conformacional se implementa utilizando un potencial MM (Amber 99).
• Una dinámica molecular de búsqueda conformacional se implementa utilizando un método semi-empírico (de Abrir Mopac o PCGamess).
• La migración de funciones de dibujo GDK a Cairo:. Cruz-dispositivo de representación de gráficos vectoriales
• El Cairo se utiliza ahora para el widget Gabedit XYplot (utilizado por Gabedit de unas frecuencias de sorteo).
• El Cairo se utiliza ahora para la ventana de dibujo geometría.
• Geometría se puede exportar en eps, ps, pdf o archivo svg.
• Las curvas de la ventana XYplot se puede exportar en eps, ps, pdf o archivo svg.
• Nueva herramienta para calcular la distancia entre 2 puntos en la ventana XYPlot. & Quot; Control + botón de cambio & quot; se puede utilizar para hacer un zoom en la ventana XYPlot.
• La nueva versión de PCGamess (luciérnaga) es ahora compatible

¿Qué hay de nuevo en la versión 2.1.13:

• Errores menores fueron fixe
• Un dinámica molecular de búsqueda conformacional se implementa utilizando un potencial MM (Amber 99).
• Una dinámica molecular de búsqueda conformacional se implementa mediante un potencial de semi-empírica (usando MOPAC o PCGAMESS).
• Se puede optimizar la geometría interactiva utilizando el método MOPAC o PCGamess semi-empírica, desde la ventana de geometría Draw
• La migración de funciones de dibujo GDK a Cairo: Cruz-dispositivo de representación de gráficos vectoriales. Cairo ahora se utiliza para el widget Gabedit XYplot (utilizado por Gabedit de unas frecuencias de sorteo). Cairo ahora se utiliza para la ventana de dibujo geometría.
• Geometría se puede exportar en eps, ps, pdf o archivo svg. Las curvas de la ventana XYplot se pueden exportar en eps, ps, pdf o archivo svg.
• Nueva herramienta para calcular la distancia entre 2 puntos en la ventana XYPlot. & Quot; & quot control Botón + izquierda; se puede utilizar para hacer un zoom en la ventana XYPlot.
• La nueva versión de PC Gamess / Firefly es ahora compatible

Requisitos

• gtk +