misopy

MISO (mezcla de isoformas) es un marco probabilístico escrito en Python que cuantifica el nivel de & nbsp expresión; de genes empalmados alternativamente a partir de datos de RNA-Seq, e identifica isoformas o exones diferencialmente regulados a través de muestras.
Al modelar el proceso por el cual lee generativa se producen a partir isoformas en RNA-Seq, el modelo MISO usa la inferencia bayesiana para calcular la probabilidad de que una lectura originó a partir de una isoforma particular.
MISO utiliza la asignación inferido de lecturas a isoformas para cuantificar la abundancia del conjunto subyacente de mRNA isoformas alternativas. Los intervalos de confianza sobre las estimaciones pueden ser obtenidos, que cuantificar la fiabilidad de las estimaciones.
Por favor consulte el manual de http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ MISO y documentación

Requisitos :.

• Python