SIGINT proyecto es una herramienta de software de línea de comandos que se puede utilizar para encontrar y clasificar las proteínas de mamíferos / genes que específicamente y significativamente interactúan con una lista de proteínas / genes en el contexto de un fondo signalome mamíferos y redes interactome.
Las entradas al programa son: (a) una lista de semillas de los símbolos de genes Entrez Gene humanos, (b) a las redes de fondo en formato SIG, y (c) un nombre para el archivo de salida (página web de nombre de archivo con la extensión htm ). SIGINT da salida a una lista ordenada de genes / proteínas que interactúan con los componentes de la lista de semillas. Estos componentes están ordenados por una puntuación z que mide la especificidad de estos componentes intermedios para interactuar con los genes / proteínas a partir de la lista de semillas.
SIGINT se puede ejecutar en sistemas operativos Linux, Mac y Windows y requiere un archivo de texto a la red de fondo en formato SIG.
Uso:
Extraer el archivo
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
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