GENESIS (abreviatura de generales Neural Simulation System) es una plataforma de simulación de propósito general que se desarrolló para apoyar la simulación de sistemas neuronales que van desde componentes subcelulares y reacciones bioquímicas a modelos complejos de neuronas individuales, simulaciones de redes grandes y Sistemas modelos de nivel.
GENESIS ha servido de base para cursos de laboratorio de simulación neuronal en Caltech, el Laboratorio de Biología Marina, el Creta, Trieste, Bangalore y Obidos cursos cortos en Neurociencia Computacional, y al menos 49 universidades de las que somos conscientes.
La mayoría de las aplicaciones actuales GENESIS involucran simulaciones realistas de los sistemas neuronales biológicos. Aunque el software también puede modelar redes más abstractos, otros simuladores son más adecuados para backpropagation y modelado conexionista similar.
Instalación
1. Escoja el lugar donde desea instalar la "génesis" árbol de directorios. Si va a realizar una instalación de todo el sistema como usuario "root", / usr / local es una buena opción. Para una instalación personal, sin privilegios de root, puede utilizar su directorio de inicio ("~"). Cambie a este directorio y extraer el directorio génesis del archivo de almacenamiento genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Por ejemplo,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
o desde donde quiera que lo tiene (por ejemplo ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Vaya al directorio "génesis" y ejecutar el script de instalación que crea el ".simrc" archivo de inicialización GENESIS ". Entonces copia .simrc a su directorio.
cd génesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. finallly, agregue el directorio génesis de su ruta de búsqueda, por lo que "génesis" se puede encontrar desde cualquier directorio que se encuentre. Si su shell de entrada es bash, usted puede hacer esto editando el archivo .bashrc en su directorio personal añadir la línea
PATH = $ PATH: / usr / local / génesis
al final del archivo. Si está utilizando csh tcsh o como su consola de comandos, agregue
set path = ($ ruta / usr / local / génesis)
a tu .tcsh o archivo .csh.
En este punto, usted está listo para intentar ejecutar GENESIS. Cambie en el directorio / Scripts génesis y probar algunos de los tutoriales que se sugieren en el archivo README
¿Qué hay de nuevo en esta versión:.
- Numerosas correcciones de errores y mejoras.
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