SimSoup

SimSoup es un simulador de Química artificial gráfica para Linux y Windows.
El programa permite a una química que se define en términos de tipos de la molécula y las posibles interacciones entre ellos. Una ejecución de la simulación implica la creación de un número de moléculas de diversos tipos de la molécula en un reactor, y luego permitiendo interacciones para tener lugar durante un período de tiempo. Las interacciones que tienen lugar en el reactor se muestran en una pantalla gráfica.
La motivación para el desarrollo del programa es permitir a las investigaciones sobre el comportamiento de las redes, en particular en relación con el "metabolismo primero" teorías del origen de la vida, aunque el diseño básico de SimSoup soporta el modelado de cualquier red en la que las interacciones pueden tener lugar entre nodos.
Actualmente, el desarrollo SimSoup ha llegado a la etapa de prototipo.
Aquí están algunas características clave de "SimSoup":
ย ท Una Química: Incluyendo Tipos molécula y tipos de interacción
ย ท Un reactor: en que las interacciones llevará a cabo entre las moléculas de los distintos tipos
ย ท vistas gráficas de la Química y Reactor Estado
ย ท Visualización gráfica de Estadísticas de simulación, incluyendo: -
- Parcelas de series temporales: Estos muestran el comportamiento de series de tiempo de una serie de variables que se vigila como las corridas de simulación
- Manhattan Terreno: Esto muestra la variabilidad en la composición del material en el reactor con el tiempo
ย ท Trackers y Ciclo Detección (NUEVO): Estos ciclos permiten al ser detectados y controlados
ย ท Conservación Misa
ย ท Calor y Termodinámica (NUEVO): Las velocidades de reacción se basan en consideraciones de la energía y la termodinámica
ย ท Escenario Pantalla: Una pantalla de la información del escenario y el estado actual de sus progresos
ย ท Solicitudes de Acciones (NUEVO): Estos son eventos que pueden ser programados para llevarse a cabo en momentos concretos. Por ejemplo, una solicitud de acción puede ser configurado para producir una molécula de un tipo particular que se añade al reactor
ย ท Procesador de entrada (NUEVO): Esto permite a un escenario de simulación que se define en un archivo y se carga a SimSoup
ย ท Monitor de sistema: una pantalla (en parte oculta) - principalmente para fines de diagnóstico
ย ท Mejora de la interfaz de usuario basada totalmente en GTK (NUEVO)
Requisitos:
ย ท GSL (GNU Scientific Library)
ย ท gtkmm (A C ++ interfaz para la biblioteca GTK + GUI)
¿Qué hay de nuevo en esta versión:
ย ท Trackers y Detección Ciclo: Estos ciclos permiten al ser detectados y controlados
ย ท Calor y Termodinámica: Las velocidades de reacción se basan en consideraciones de la energía y la termodinámica
ย ท Solicitudes de Acción: Estos son eventos que pueden ser programados para llevarse a cabo en momentos concretos. Por ejemplo, una solicitud de acción puede ser configurado para producir una molécula de un tipo particular que se añade al reactor
ย ท Procesador de entrada: Esto permite a un escenario de simulación que se define en un archivo y se carga a SimSoup
ย ท Mejora de la interfaz de usuario basada totalmente en GTK.