Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere ofrece una combinación única de la literatura-minería y análisis de vías para los biólogos moleculares interesados ​​en la regulación de genes y redes biológicas.
 BiblioSphere Camino Edition utiliza una base de datos completa de relaciones modeladas individualmente entre los genes, las proteínas, los complejos, las células y los tejidos, junto con técnicas de minería de arriba-hasta la fecha de texto para la extracción de conocimiento automatizado que le permite vincular sus datos a las redes biológicas en diferentes contextos biológicos.
 Utilice BiblioSphere a

• extienden más allá de las redes biológicas información canónica vía (reglamentario y metabólico)
• fusionar sus resultados de alto rendimiento con el conocimiento biológico y secuencia de análisis basados ​​
• realizar contexto- análisis de la vía reguladora sensible a
• generar variantes de experimento específico vía
• enlace vías para acceder a los mecanismos y genes de la enfermedad
• avanzado diseño experimental

¿Qué hay de nuevo en esta versión:

Nuevo y Mejorado Fuentes de datos

• Genomatix Experto Curated gen-gen Relaciones:
   Genomatix ha integrado su propia base de conocimientos de los datos comisariada expertos sobre la regulación de genes en BiblioSphere. Esta fuente de datos única, añade la semántica de las relaciones gen-gen a las BiblioSphere redes de genes generadas dinámicamente, proporcionando información como "Gene A activa la transcripción de genes B" o "Gene A interacciona físicamente con el gen B".
  
• Vías de transducción de señales:
   Algunas partes de ontología de genes relevantes para la transducción de señales, así como los datos recopilados de la bibliografía se han combinado para permitir la identificación de las vías canónicas vinculadas a la red enfocada.
  
• metabólicos Pathway Asociaciones:
   Asociaciones vía metabólica se han integrado para permitir la identificación de eventos metabólicos relacionados con su conjunto de genes.
  

• Pathway Ver con expertos comisariada relaciones gen-gen
   Grupos de genes se compilan en gráficos de redes dinámicas de fácil comprensión que combinan comisariada mano relaciones gen-gen con los datos derivados de la extracción de conocimiento automatizado. Las redes pueden ser personalizados por los filtros y se enfocaron de manera gen centrado para realizar análisis de la ruta más corta.
  
• Celular Localización Ver
   Sobre la base de GO anotaciones genes están asignados a su localización subcelular y visualizado como un diseño de celda diagramado, que le permite identificar regiones subcelulares y compartimentos pertinentes a su conjunto de genes.
  

• Gestión de proyectos: Administre sus análisis organizándolos en carpetas de proyecto. Acceda rápidamente a los resultados anteriores con unos pocos clics del ratón o añadir nuevas búsquedas para proyectos existentes.
  

• Varios pequeñas mejoras y correcciones de errores

Requisitos :

• Mac OS X 10.2 o superior
• Java 1.4.1 (actualización 1 se recomienda)
• conexión a internet
• una cuenta de evaluación Genomatix (gratis)