CWC Simulator

CWC Simulator es un C ++ aplicación del CAQ, un cálculo para la representación y simulación de sistemas biológicos. & Nbsp; Después de una instalación correcta (ver INSTALAR) podrás ejecutar simulaciones sobre modelos CWC, como se muestra en algunos ejemplos (ver ejemplos /).
(línea de comandos) Interfaz
Como usuario genérico, debe ejecutar:

model.cwc -i
-o
-t
-s
-n
-c
--qt-umbral
-q
-w <> trabajadores
Dónde:
- es el nombre del ejecutable (por defecto: scwc);
& Nbsp; - model.cwc es el programa CAQ entrada (ver ejemplos);
& Nbsp; - estadísticas es el prefijo de salida de archivos;
& Nbsp; - es el límite de tiempo de simulación;
& Nbsp; - es el periodo de muestreo (es decir, 0,12 para conseguir 250 puntos con plazo = 30);
& Nbsp; - es el número de casos de simulación;
& Nbsp; - es el número de grupos de k-medias
& Nbsp; - es el umbral para la agrupación QT
& Nbsp; - es el número de cuantiles;
& Nbsp; - tiene por lo general para que coincida con el número de núcleos de su sistema (es decir, 4 para la CPU de cuatro núcleos).
Salida
La herramienta produce:
- Algunos archivos .dat (la salida de la muestra de las simulaciones)
- Algunos scripts gnuplot para dibujar analysises estadísticos
Estamos trabajando en un manual de usuario completo

Características .

• algoritmo de Gillespie SSA sobre modelos CWC
• estocástico híbrido / semántica deterministas
• Varias instancias de simulación con estadísticas en línea
• Optimización para arquitecturas multinúcleo basado en marco FastFlow
• marco estadístico Extensible (media-varianza, filtrada agrupación etc.)
• Múltiples semántica de calificación (la acción de masas, Michaelis-Menten, Colina, etc.)