MacMolPlt

MacMolPlt es una herramienta de visualización Química que se puede utilizar para construir moléculas con un constructor de modelos gráfica integrada, crear archivos de entrada para el programa de química computacional GAMESS, y luego visualizar los resultados de carreras de química computacional. Las características incluyen una pantalla 3D de alta calidad, las animaciones de los modos normal y secuencias de reacción y de salida a una variedad de formatos, incluyendo imágenes de alta calidad y películas QuickTime y Flash.

• se usa la Entrada:
• formato de archivo MolPlt perforado por GAMESS
• pegando en coordenadas cartesianas de cualquier GAMESS o Gauss archivo de registro
• cualquier entrada GAMESS, ingrese o archivo irc
• archivo XYZ estilo XMol
• archivos de formato Molden
• Protein Data Bank (PDB ) presentar
• Chemical Markup Language (LMC) archivos
• Construir gráficamente con un editor molécula interactivo
• Build a mano utilizando coordenadas internas estilo cartesiano o Z-Matrix
• pantalla 3D de la estructura y el modo Normal
• Animación de modos normales.
• rotación 3D en tiempo real y traducciones bajo el control del ratón
• Cálculo de cualquier parámetro Z-matriz
• medida Visualmente / mostrar distancias, ángulos y diedros.
• Creación automática de menor movimiento (LLM) trayectorias lineales
• cálculo y la visualización de 2D y 3D:
• orbitales moleculares (AO de, MO de, o OVM de)
• Electrónico Total Densidad
• Las diferencias de densidad
• Molecular electrostática Potenciales (MEPMaps)
• Basic generador de archivos de entrada para GAMESS
• OpenGL utilizado para el procesamiento 3D de alta calidad
• Apoyo a la simetría molecular
• Generar átomos dependientes simetría
• Determine simetría átomos únicos
• Determinar automáticamente la lista de grupos de puntos apoyados por un conjunto de coordenadas.
• Rotar coordina en la orientación correcta principio
• Pantalla operadores de simetría para muchos grupos de puntos
• salida de calidad de publicación (color o blanco y negro) a través de impresión directa o copiar y pegar en otra aplicación.
• La producción en una variedad de formas, incluyendo Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, películas flash y películas QuickTime.

¿Qué hay de nuevo en esta versión:

Varias mejoras se han hecho para el código de visualización. Opciones se han añadido al panel 3D de los prefernces para sombreado suave con y sin sombras.
Añadido soporte rudimentario para archivos Mopac.
Opción para cambiar la visibilidad de ab initio, MM, y los átomos de EFP Añadido.
Mejorado el soporte para modelos Core Potenciales.
Añadido un gancho en el constructor de entrada para el nuevo programa GAMESSQ.
Mejora el analizador de archivos PDB.