MultiGeneBlast es una herramienta de código abierto basado en un cambio de formato de las cabeceras FASTA de entradas de proteínas NCBI GenBank, utilizando lo que se puede rastrear su nucleótidos y coordenadas fuente. MultiGeneBlast puede ayudar en la detección de este tipo de piezas de múltiples genes para proyectos de biología sintética. Una biblioteca sintética de operones se puede crear sobre la base de su salida a identificar a los operones cuya función es la más cercana a la deseada por el usuario. Esta herramienta proporciona las oportunidades para identificar todas las regiones genómicas homólogas mediante la combinación de los resultados de un solo BlastP ejecuta en cada gen, y la clasificación de regiones genómicas de cualquier entrada GenBank por el número de accesos, conservación synteny, y la puntuación explosiva poco acumulativo. Arquitectura búsquedas se pueden realizar para encontrar regiones genómicas con Blast hits a cualquier combinación especificada por el usuario de las secuencias de aminoácidos.
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