PANAMA

PANAMÁ es una novela modelo probabilístico para tener en cuenta factores de confusión en los estudios eQTL, escritos en Python.
Factores de confusión ocultos, como covariables observadas o perturbaciones ambientales sutiles desconocidos pueden crear falsas asociaciones espurias o enmascarar las señales de asociación genética reales. En contraste con los métodos anteriores, PANAMÁ aprende factores ocultos conjuntamente con el efecto de los reguladores genéticos prominentes. Como resultado, este nuevo modelo puede distinguir con más precisión las señales verdaderas de asociación genética de la variación de los factores de confusión.
N. Fusi, oh. Stegle y ND Lawrence, "modelización conjunta de los factores de confusión y reguladores genéticos prominentes proporciona una mayor precisión en los estudios de genética genómica", PLoS Computational Biology, 2012
Más información en http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

• Python