Libre Bioinformática Para Linux
Seal es un módulo de Python que proporciona la alineación de secuencias de Hadoop.Seal es una de MapReduce solicitud de alineamiento de secuencias biológicas. Se ejecuta en Hadoop (http://hadoop.apache.org) a través Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net),...
TRMiner es una utilidad Python que apunta a curadores de datos científicos. & Nbsp; Permite podar rápidamente grandes colecciones de publicaciones científicas a las oraciones pertinentes para un objetivo de minería dado.Esto se logra en dos pasos. En...
Pysam es un módulo de Python para leer y manipular Samfiles & nbsp;. Es un contenedor ligero de la samtools C-API.La guía de inicio rápido está aquí. Documentación más detallada está disponible aquí.Preguntas y comentarios son muy bienvenidos y deben ser...
PySCeS es un proyecto desarrollado por la Triple-J Grupo de Molecular Cell Fisiología. & Nbsp; con el fin de tratar de modelo y de comprender los complejos procesos y sistemas que componen la célula viva Características :. Un texto basado en la...
gobio es una API de Python para la lectura de archivos de datos binarios creado usando el marco de gestión de datos del gobio de próxima generación.Normalmente, este directorio viene como parte del paquete de gobio completa, disponible a partir de:& Nbsp;...
SSuMMo es una biblioteca de funciones diseñadas alrededor iterativa usando hmmer asignar secuencias de taxones. & Nbsp; Los resultados son árboles muy comentadas muestran especies / distribución de género dentro de esa comunidad.Programas incluidos en el...
Burrows-Wheeler alineador (BWA) es un programa eficiente que alinea las secuencias de nucleótidos relativamente cortos contra una secuencia de referencia largo, como el genoma humano.El software implementa dos algoritmos, BWA-corto y BWA-SW. El primero...
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OpenElectrophy es un marco para facilitar la manipulación, almacenamiento y análisis de datos electrofisiológicos. Puede importar datos de diferentes formatos de archivo y guardarlos en una sola base de datos de tipo SQL.Las herramientas de análisis...
NEO (Neural Ensemble Objetos) y es un proyecto para proporcionar un conjunto común de clases base que se utilizará en el análisis de datos de los nervios, con el objetivo de conseguir OpenElectrophy, NeuroTools y tal vez otros proyectos con objetivos...
