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PASOS es un paquete de simulación estocástica exacto de sistemas de reacción-difusión en arbitrariamente complejas geometrías 3D. Nuestro algoritmo de simulación de núcleo es una implementación de SSA de Gillespie, extendió para hacer frente a la difusión...
TRMiner es una utilidad Python que apunta a curadores de datos científicos. & Nbsp; Permite podar rápidamente grandes colecciones de publicaciones científicas a las oraciones pertinentes para un objetivo de minería dado.Esto se logra en dos pasos. En...
El Sistema de Referencia La bioinformática es un intento de construir un marco razonable de pruebas, pruebas y datos, para permitir a los usuarios finales y los proveedores para probar el rendimiento de sus sistemas.Lo que estamos tratando de hacer es...
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AREM se basa en una MACS (Análisis basado en modelo para datos de chip Sec).Secuenciación de alto rendimiento acoplado a inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-Seq) es ampliamente utilizado en la caracterización de todo el genoma patrones de unión de...
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MetagenomeDB es una biblioteca de Python diseñado para almacenar fácilmente, recuperar y anotar secuencias metagenómica. & Nbsp; MetagenomeDB actúan como una capa de abstracción en la cima de una base de datos MongoDB. Proporciona una API para crear y...
Seal es un módulo de Python que proporciona la alineación de secuencias de Hadoop.Seal es una de MapReduce solicitud de alineamiento de secuencias biológicas. Se ejecuta en Hadoop (http://hadoop.apache.org) a través Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net),...
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