CLC DNA Workbench

CLC ADN Workbench crea un entorno de software que permite a los usuarios realizar un gran número de secuencia de ADN avanzada analiza, junto con la gestión de datos sin problemas, y excelentes opciones de visualización y salida de gráficos.
CLC ADN Workbench está disponible en Windows, Mac OS X, y las plataformas Linux

Características .

• Bioinformática cuenta en Banco de trabajo de Gene :
• visualización flexible de moléculas circulares.
• Editor para el primer diseño gráfico y algoritmos avanzados
• Asamblea de datos de secuencias de ADN
• La clonación molecular
• SNP automática anotación de secuencias
• Búsqueda y descubrimiento de patrones de ADN
• analiza región complejidad local
• traducción inversa de la proteína de gen, basado en tablas de traducción de un número de especies
• el análisis y la gestión de la enzima de restricción Avanzada
• Dot análisis basados ​​trama
• Estadísticas de ADN de forma breve, incluyendo una serie de características de una molécula dada
• NCBI secuencia de búsqueda de datos
• El acceso a la información web desde PubMed
• Otras características bioinformática:
• ADN, ARN y editor de secuencia de la proteína se presentan tanto en moléculas lineales y circulares
• ADN, ARN y editor de alineación de proteínas
• logos interactivos a lo largo de las dos alineaciones de ADN, ARN y proteínas
• El procesamiento por lotes de los análisis de secuencias múltiples en una sola obra a paso
• Búsqueda Motif
• descubrimiento del patrón (patrones desconocidos)

Opción de alineación
• Avanzado realineación y fijar puntos
• logo Secuencia gráficos a lo largo de ADN, ARN y proteínas alineaciones
• anotación manual de secuencias
• Búsquedas Integrado PubMed
• secuencia de búsqueda basado en la Web utilizando BLAST
• Dot análisis basados ​​trama
• Región complejidad local analiza y parcelas complejidad
• gráficos fracción Gap
• análisis y gráficos de contenido de G / C
• Proyecto y gestión de datos:
• La plena integración de la entrada de datos, gestión de datos, los resultados del cálculo, y la exportación de datos
• registro de historial detallado
• Todos los tipos de archivos se pueden guardar en proyectos locales, y puso en marcha desde el programa
• Importación y exportación de datos en un gran número de formatos de archivo
• Opción de trabajar en varios espacios de trabajo activas a la vez, lo que permite el trabajo simultáneo en múltiples proyectos
• Importación de archivos de datos traza y puntuaciones de calidad de máquinas sequening automáticos de ADN utilizando Estándar Cromatograma, formatos ABI y el formato PHD (PHRED)
• Visualización y presentación de informes:
• Vista Avanzada BLAST

Ver
• gráficos avanzados
• Vista avanzada histograma
• Avanzado vista gráfico de puntos
• Búsqueda de características en las secuencias y alineaciones

Requisitos

• 256 MB de RAM necesarios
• 512 MB RAM recomendado
• 1024 x 768 pantalla recomendada

Limitaciones

• demostración de 4 semanas completamente funcional