herramienta de línea de comandos para la comparación de archivos de datos delimitados por comas utilizando diferencias relativas para determinar las conformaciones más similares. Compsort compara los archivos de datos mediante la diferencia relativa, calcula una puntuación de similitud, ordena los resultados en orden ascendente (los valores más bajos representan una mayor similitud), ahorra X número de bajas calificaciones.
Los archivos de datos producidos por el usuario, deben ser archivos de texto delimitados por comas. Cada archivo representa una molécula única. Cada fila en un archivo representa una conformación única de la molécula. La primera columna del archivo de datos debe ser una etiqueta única para la conformación representada por la fila. El resto de las columnas son descriptores numéricos, tales como mediciones de distancia de espacio.
Las filas se comparan combinatoria entre los archivos. Las etiquetas de comparación se concatenan y se guardan con las puntuaciones para el conjunto de filas. Esto proporciona una manera de identificar las conformaciones que produjeron una puntuación de similitud dado.
El trabajo futuro incluye:
- añadiendo interfaz GUI
- publicar papel en mi algoritmo de modelado 3D pharmacophore
- Una versión paralela usando MPI
¿Qué hay de nuevo en esta versión:
- fija un par de menor advertencias del compilador
- añadió la notificación de tiempo de cálculo para el conjunto de cálculos combinatorios, además del tiempo de clase se informó anteriormente
- aumento de nivel de optimización del compilador del binario
Requisitos :
Mac OS X 10.3
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