Ghemical es un paquete de software de química computacional publicado bajo la licencia GNU GPL. Esto significa que el código fuente completo del paquete está disponible, y los usuarios tienen libertad para estudiar y modificar el paquete. Ghemical está escrito en C ++.
Ghemical proyecto cuenta con una interfaz gráfica de usuario (que se basa en GNOME), y es compatible tanto con la mecánica cuántica (semi-empírica y ab initio) modelos y modelos de mecánica molecular (hay un examen final campo de fuerza 5.2-como experimental para molecu orgánica también una herramienta para los modelos reducidos de proteínas [1] está incluido. Optimización de geometría, dinámica molecular y un amplio conjunto de herramientas de visualización están disponibles actualmente.
Ghemical basa en código externo para proporcionar los cálculos de la mecánica cuántica. Métodos semi-empíricos MNDO, MINDO / 3, AM1 y PM3 vienen del paquete MOPAC7 (Dominio Público), y se incluyen en la distribución fuente.
El paquete MPQC (GNU GPL) se utiliza para proporcionar métodos ab initio: los métodos basados en la teoría de Hartree-Fock son compatibles actualmente con los sistemas básicos que van desde STO-3G para 6-31G **.
El código MPQC no se incluye en la distribución fuente. Para utilizar el ab initio MPQC basada en métodos en Ghemical, primero debe compilar e instalar el programa MPQC para su sistema, y luego compilar Ghemical utilizando algunos ajustes específicos que enlazan los programas juntos; consulte el archivo INSTALL para más información. Ghemical también contiene el paquete openbabel para la importación y exportación de muchos formatos de archivo diferentes (así como otras tareas).
Instalación
Una vez que haya descargado la última versión, debe extraer todos los archivos de su archivo de almacenamiento utilizando "alquitrán -zxvvf Ghemical-1.00.tgz" o equivalente "gunzip Ghemical-1.00.tgz; alquitrán -xvvf Ghemical-1.00.tar". Después de eso por favor, lea el "INSTALAR" -file que acaba de extraer para obtener información adicional.
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