Viendo la proteína-proteína y proteína-ligando interacciones como gráficos (redes), donde las biomoléculas se representan como nodos y sus interacciones se representan como enlaces, es un enfoque prometedor para la integración de los resultados experimentales de diferentes fuentes para lograr la comprensión sistemática de los mecanismos moleculares conducir el fenotipo celular. La aparición de redes de señalización en gran escala ofrece una oportunidad para el análisis estadístico topológico, mientras que la visualización de este tipo de redes representa un desafío. SAVI implementa métodos estándar para calcular la agrupación, distribución de la conectividad y la detección, así como la visualización, de motivos de la red. Además, SAVI genera una página web completa de conjuntos de datos de la red en formato de texto. SAVI contiene una herramienta llamada PathwayGenerator. Esta herramienta crea mapas de conexión como las páginas web de los grandes cuadros que describen las interacciones de señalización celular. SAVI también puede crear redes de listas de nombres de genes / proteínas
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