MultiDendrograms

MultiDendrograms es una aplicación sencilla pero potente para que la agrupación jerárquica de los datos reales, distribuidos bajo una licencia de código abierto. & Nbsp; a partir de una distancia (o pesos) matriz, MultiDendrograms calcula su dendrograma utilizando los algoritmos aglomerativo jerárquica Clustering más comunes , permite la sintonización de muchos de los parámetros de representación gráfica, y los resultados se pueden exportar fácilmente a un archivo. Un resumen de las características:
- Multiplataforma: desarrollado en Java, funciona en todos los sistemas operativos (por ejemplo, Windows, Linux y MacOS).
- Interfaz gráfica de usuario: selección de datos, opciones de agrupación jerárquica, los parámetros de representación dendrograma, la navegación a través de la dendrograma, medidas de desviación.
- Algoritmos jerárquicos Clustering implementadas:-grupo de variables Individual Vinculación, vinculación completa, promedio no ponderado, promedio ponderado, centroide no ponderado, centroide ponderado y conjunta entre-dentro.
- parámetros de representación: tamaño, orientación, etiquetas, ejes, etc.
- Medidas de desviación: cophenetic coeficiente de correlación, normalizada Mean Squared Error y Error Normalizado Mean Absoluto.
- Exportación: matriz ultrametric, detalles dendrograma en texto y formatos árbol Newick.
- Parcela: Imagen dendrograma en formato JPG, PNG y EPS formatos.
MultiDendrograms implementa el grupo variable de algoritmos en resolver el problema de no unicidad encontrado en los algoritmos e implementaciones par de grupos estándar. Este problema surge cuando dos o más distancias mínimas entre los diferentes grupos son iguales durante el proceso de amalgamación. El enfoque estándar consiste en elegir un par, rompiendo los lazos entre las distancias, y procede de la misma manera hasta que se obtiene la clasificación jerárquica final. Sin embargo, los diferentes agrupamientos son posibles dependiendo del criterio utilizado para romper los lazos (por lo general un par apenas elegido al azar!).
El grupo de algoritmos de grupo variable de más de dos grupos al mismo tiempo cuando se producen los lazos, dado lugar a una representación gráfica llamada multidendrogram. Sus propiedades principales son:
- Cuando no hay empates, los algoritmos de grupos de variables dan los mismos resultados que los par-grupo.
- Ellos siempre dan una solución determinada manera única.
- En la representación multidendrogram de los resultados se puede observar de forma explícita la existencia de lazos durante el proceso de aglomeración. Además, la altura de cualquier intervalo de fusión (las bandas en el programa) indica el grado de heterogeneidad dentro del grupo correspondiente

Requisitos .

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment